Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm6880A3KG45 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm6880A3KG45 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm6880A3KG45 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm6880A3KG45 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Gm6880A3KG45 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm6880A3KG45 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm6880A3KG45 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm6880A3KG45 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm6880A3KG45 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm6880A3KG45 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm6880A3KG45 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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