Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Samt1A2BED8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms