Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prdm2A2A7B5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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