Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms