Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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