Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Vamp5Q9Z2P8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Vamp5Q9Z2P8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Vamp5Q9Z2P8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Vamp5Q9Z2P8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Vamp5Q9Z2P8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Vamp5Q9Z2P8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms