Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms