Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sema6cQ9WTM3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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