Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Six6Q9QZ28 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms