Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TefQ9JLC6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefQ9JLC6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms