Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp29Q9ES63 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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