Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clstn2Q9ER65 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms