Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc97Q9DBT3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc97Q9DBT3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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