Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ftsj3Q9DBE9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ftsj3Q9DBE9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms