Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc94Q9D6J3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms