Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm5Q9D6G9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms