Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PudpQ9D5U5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms