Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms