Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms