Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhd1Q9D4J1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhd1Q9D4J1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms