Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Obox1Q9D350 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox1Q9D350 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms