Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Susd3Q9D176 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Susd3Q9D176 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Susd3Q9D176 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Susd3Q9D176 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Susd3Q9D176 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Susd3Q9D176 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms