Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms