Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NkapQ9D0F4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms