Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Shmt2Q9CZN7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Shmt2Q9CZN7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Shmt2Q9CZN7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Shmt2Q9CZN7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Shmt2Q9CZN7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Shmt2Q9CZN7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Shmt2Q9CZN7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Shmt2Q9CZN7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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