Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms