Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms