Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms