Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prpf8Q99PV0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms