Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms