Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gins4Q99LZ3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms