Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sh3bp5lQ99LH9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms