Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rnf183Q8QZS5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf183Q8QZS5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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