Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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