Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vrk3Q8K3G5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vrk3Q8K3G5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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