Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Trpt1Q8K3A2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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