Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nup88Q8CEC0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup88Q8CEC0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms