Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Samd4aQ8CBY1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms