Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops7bQ8BV13 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms