Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim65Q8BFW4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim65Q8BFW4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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