Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lrrc1Q80VQ1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lrrc1Q80VQ1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms