Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mindy1Q76LS9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mindy1Q76LS9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms