Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Zbtb40Q6PCS8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Zbtb40Q6PCS8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Zbtb40Q6PCS8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Zbtb40Q6PCS8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb40Q6PCS8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Zbtb40Q6PCS8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb40Q6PCS8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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