Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp12Q6P5B0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms