Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Fndc3c1Q6DFV6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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