Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spty2d1Q68FG3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms