Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Znf280dQ68FE8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Znf280dQ68FE8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Znf280dQ68FE8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Znf280dQ68FE8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf280dQ68FE8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Znf280dQ68FE8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Znf280dQ68FE8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf280dQ68FE8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf280dQ68FE8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf280dQ68FE8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf280dQ68FE8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf280dQ68FE8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf280dQ68FE8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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