Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lrrc8eQ66JT1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc8eQ66JT1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms