Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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