Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx3xQ62167 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms